Il primo taglio è fatto con una forma di Y. I bracci della Y si estendono dalla parte anteriore di ogni spalla fino l'estremità inferiore dello sterno. La coda della Y si estende dallo sterno fino l'osso pubico e tipicamente devia per evitare l'ombelico. L'incisione è molto profonda. La pelle dopo questo taglio viene rialzata, con la parte superiore tirata sopra la faccia.
Le nervature allora vengono tagliate fuori e lo sterno o la parete anteriore della cassa toracica è tagliata via, per esporre gli organi sottostanti. Il modo più comune di rimuovere gli organi è conosciuto come il metodo di Rokitansky. Gli organi sono rimossi tagliando i loro collegamenti al corpo uno per uno.
Il cervello è rimosso usando un'incisione trasversale attraverso il cranio, tagliando il collegamento alla base con il midollo spinale. Il cervello è allora disposto in una soluzione di 20% di formalina per un'analisi futura.
Tutti gli organi rimossi sono pesati individualmente e studiati. La maggior parte degli organi sono tagliati in sezioni con uno scalpello.
Gli intestini sono svuotati in un contenitore per rimuovere gli alimenti non digeriti e le feci rimanenti.
Lo stomaco è aperto e tagliato sulla relativa curvatura più grande e ne viene esaminato il contenuto.
Sono prelevati campioni microscopici della maggior parte degli organi per un'ulteriore analisi.
Per concludere, tutti i vasi sanguigni importanti vengono aperti ed esaminati longitudinalmente.
Gli organi vengono ridisposti nel corpo e questo a volte può essere riempito da un materiale riempitore.
Una volta che l'incisione di Y è ricucita, l'autopsia (senza l'analisi dei tessuti e del cervello) è completa.